Formation 3DSlicer

3DSlicer est une application dédiée à la visualisation et à l’analyse de données volumiques. Basée sur des bibliothèques libres et elle-même sous licence BSD, elle offre une interface intuitive donnant accès à des algorithmes de traitements d’image évolués. 3DSlicer est conçue comme une plate-forme de développement adaptée aux projets de recherche gravitant autour d’applications en imagerie. Cet outil est aujourd’hui utilisé dans une multitude de projets, de l’imagerie médicale (cérébrale, chirurgie assistée, IRMf) à l’astronomie en passant par la paléontologie.

Cette formation s’adresse aux utilisateurs d’outils de visualisation scientifique, mais aussi aux développeurs désireux d’apporter une personnalisation souvent indispensable à une application spécifique.

Slicer

Objectifs

  1. Comprendre l’interface de 3DSlicer
  2. Charger/Sauvegarder des données (DICOM, modèles surfaciques,…)
  3. Ecrire des scripts Python
  4. Utiliser des algorithmes de segmentations et de recalage

Prérequis

Connaissances de base en imagerie (volume, traitements)

Programme

  • Comprendre l’interface de 3DSlicer
    • Eléments habituels de visualisation scientifique ou d’imagerie médicale
    • Séquences d’interactions originales
  • Charger/Sauvegarder des données (DICOM, modèles surfaciques,…)
    • Diversité des formats supportés
    • Charger, visualiser, sauvegarde, exporter
  • Utiliser des algorithmes de segmentation et de recalage
    • Segmentation manuelle et semi automatique
    • Algorithmes de traitement d’image avancés
    • Croissance de région
    • Recalage manuel et semi automatique
  • Ecrire des scripts python
    • Modifier l’interface dans un environnement de programmation simplifié
    • Développer ses propres fonctionnalités et les intégrer dans l’interface
    • Traitement d’images avec NumPy

Cette formation sera donnée en anglais sauf si tous les participants maîtrisent la langue française.

Pour cette formation, chaque participant doit venir avec son ordinateur portable. Les spécificités d’installation seront communiquées en amont par l’instructeur.

Les supports de cours sont en anglais.

Les formations Kitware peuvent être personnalisées et dispensées selon vos besoins aux centres de formation Kitware (En Europe: Lyon, France; ou aux USA: Clifton Park, New York; Carrboro, North Carolina; Santa Fe, New Mexico) ou dans votre entreprise (demande de devis).

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Informations Pratiques

Durée: 1 journée
Prochaine Date: 1er avril 2026
Lieu: En ligne
Prix: 830€

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A propos du formateur

Sébastien est ingénieur R&D dans l’équipe Solutions Logicielles.

Sébastien est titulaire d’un diplôme d’ingénieur de l’INSA Lyon (France), où il a étudié l’informatique et les technologies industrielles. Il détient également un Master en génie informatique et systèmes intelligents de Polytechnique Montréal (Canada).

Pendant ses études à l’INSA Lyon, Sébastien a participé à la création et à l’organisation d’une compétition de Coding Battle, où il a obtenu la première place lors du Cod’INSA 2021. Il a également été président du bureau étudiant INSAlgo, une organisation gérée par des étudiants et dédiée à promouvoir l’intérêt pour la résolution de problèmes algorithmiques et le codage.

Chez Kitware, Sébastien travaille sur des applications d’imagerie médicale en utilisant 3D Slicer.